Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf5P70191 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms