Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SbdsP70122 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SbdsP70122 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SbdsP70122 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SbdsP70122 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SbdsP70122 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SbdsP70122 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbdsP70122 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms