Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ThraP63058 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ThraP63058 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ThraP63058 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ThraP63058 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ThraP63058 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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