Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms