Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms