Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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