Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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