Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Itga11P61622 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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