Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp3P58854 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubgcp3P58854 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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