Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms