Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms