Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ephb4P54761 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms