Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms