Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms