Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms