Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms