Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms