Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms