Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LmnaP48678 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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