Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms