Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3caP42337 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms