Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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