Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms