Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms