Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms