Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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