Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms