Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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