Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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