Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif5cP28738 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms