Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms