Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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