Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms