Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HdcP23738 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HdcP23738 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HdcP23738 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms