Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms