Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms