Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TP20293 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TP20293 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms