Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a1P19437 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a1P19437 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a1P19437 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a1P19437 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a1P19437 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a1P19437 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms