Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RargP18911 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RargP18911 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RargP18911 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RargP18911 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RargP18911 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms