Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18530 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18530 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms