Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18529 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18529 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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P18529 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18529 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18529 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18529 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms