Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl9P18340 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl9P18340 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms