Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spi1P17433 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spi1P17433 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms