Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30aP15533 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30aP15533 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms