Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RhoP15409 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RhoP15409 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RhoP15409 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms