Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms