Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PolP10400 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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