Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms