Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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