Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnfP06804 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnfP06804 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms